Трагедията се разиграла около 11.00 часа в близост до автопарк "Елешец". Корабът „Илинден" е пътувал за манастира „Св. Наум" на югозападния край на Охридското езеро. Той се е преобърнал на около 200 до 300 м от брега на Охридското езеро.
За инцидента прокуратурата повдигна обвинения срещу капитана на „Илинден" Сотир Филески и експерта от германския „Лойд" Бранко Баич, който дал сертификата за годността на кораба, за тежко престъпление срещу сигурността на хората и имуществото в транспорта. Според прокуратурата не са спазени редица изисквания за техническата годност на кораба и неговата поддръжка. Плавателният съд е бил претоварен, като вместо допустимите 43-ма души, на борда му имало 55 туристи.
На 30 юни 2011 година македонската прокуратура отправи искане за постановяването на ефективни осъдителни присъди за двамата подсъдими.