Според църковното предание Антиохийската църква е основана от апостолите Петър и Павел през 34 г. и е най-старата християнска църква в света след Йерусалимската. Тук за първи път е използвана думата „християни“ за местната църковна община. Св. ап. Петър се смята за първи епископ на града. Проповядвал е в малка пещера на западния бряг на р. Оронт и в подножието на планината Хац (ант. Силпион), където по-късно е построен малък храм. Между 2 и 4 в. Антиохия се разраства много и малката църква се оказва разположена в центъра на града. В първоначалния си вид тя представлява сводесто пространство, издълбано в огромна скала. По-късно са добавени каменни стени и две колони, които разширяват структурата и я разделят на три кораба. Впоследствие през вековете са правени разширения и допълнения, но храмът неизменно остава символ на християнството в града.
Днес древният град Антиохия е част от Турция. През 2005 г. турската държава обяви църквата за защитен обект на културното наследство, а през 2011 г. тя е включена в списъка на обектите, кандидатстващи за списъка на ЮНЕСКО.
„Антиохия, която познавате, вече не съществува“, казват местните жители. В центъра на града са разрушени почти половината от сградите.
Антиохийската патриаршия е единствената от древните православни патриаршии, която вече не се намира в историческото си седалище. В средата на 14 в. то е преместено от Антиохия в Дамаск. Намира се в центъра на стария град, в раннохристиянския комплекс на св. Богородица Мариамита, където функционират образователни и благотворителни институции.