На 21 май 1992 г. е приета Директивата на Европейския съюз (ЕС) за опазване на природните местообитания и на дивата флора и фауна. Тази директива, заедно с Директивата за опазването на дивите птици, създават "Натура 2000".
По данни на Министерството на околната среда и водите (МОСВ) мрежата обхваща над 27 000 защитени зони в сухоземната и морската част на ЕС. В България са определени 340 защитени зони, които обхващат 34,9% от националната територия. Това са 120 защитени зони за опазване на дивите птици (23.1% територия) и 233 защитени зони за опазване на природните местообитания (30,3% територия).