За професионалния празник на НАП - 16 ноември, ден на първия евангелист свети апостол Матей с грамоти на Централното управление на агенцията са отличени директорът на ТД на НАП Варна Светлан Петков, Светослав Аврамов – директор на ОУИ Варна и 22 служители от офиса във Варна. Наградените са служители, които близо две десетилетия работят в данъчната система и са едни от пионерите на съвременната Национална агенция за приходите.

Данъчната администрация е създадена като самостоятелна структура с две постановления на Министерския съвет от 1991 г. и 1992 г. С тях се обособяват териториалните данъчни управления, данъчните служби и данъчните бюра и се определя числеността на администрацията. През 1993 г. се приемат устройственият и процесуалният закони - Законът за данъчната администрация и Законът за данъчното производство. От 2000 г. влиза в сила Данъчният процесуален кодекс, който въвежда функционална структура на данъчната администрация. Отново през март 2000 г. стартира проект за изграждане на Национална агенция за приходите (НАП) за интегриране на функциите на данъчната администрация (ДА) и функциите по събиране на осигурителни вноски на Националния осигурителен институт (НОИ).

На 18 юни 2003 г. е сключено заемно споразумение между България и Международната банка за възстановяване и развитие, което е ратифицирано от Народното събрание със закон, приет на 16 юли 2003 г. От 1 януари 2006 г. НАП започва реално да функционира, като обединява събирането и обслужването на републиканските данъци - данък върху доходите на физически лица, патентни данъци, ДДС, корпоративни данъци и задължителните осигурителни вноски - здравни, за пенсия, за допълнително задължително пенсионно осигуряване и др. Администрирането на акцизите преминава в правомощията на Агенция "Митници " от средата на същата годината. От началото на 2010 г. в НАП се влива и Агенцията за държавни вземания. С тази промяна приходната агенция започва да събира всички публични и частни държавни вземания. НАП поема и задълженията да представлява държавата в производства по несъстоятелност.